ปี พ.ศ. 2561 คำสั่งสำนักงานปลัดกระทรวงสาธารณสุขที่ 3997/2561
ลงวันที่ ๑๙ พฤศจิกายน พ.ศ. ๒๕๖๑ เรื่อง มอบหมายให้ข้าราชการปฏิบัติหน้าที่ และคำสั่งสำนักงานปลัดกระทรวงสาธารณสุขที่ ๓๙๙๘/๒๕๖๑
เรื่อง จัดตั้งสำนักโครงการพระราชดำริ โครงการเฉลิมพระเกียรติ และกิจกรรมพิเศษ ให้เป็นหน่วยงานภายใน และมีฐานะเทียบเท่ากองในสังกัดสำนักงานปลัดกระทรวงสาธารณสุข มีภารกิจในการขับเคลื่อนการดำเนินงานโครงการ
อันเนื่องมาจากพระราชดำริ โครงการเฉลิมพระเกียรติ และโครงการอันเกี่ยวเนื่องกับพระบรมวงศานุวงศ์ทุกพระองค์ ในด้านสาธารณสุขอย่างเป็นระบบ ตามนโยบายด้านสุขภาพกระทรวงสาธารณสุข และพัฒนาการบริการด้านสาธารณสุข ให้เกิดประโยชน์สูงสุดต่อประชาชน รวมทั้งเป็นหน่วยงานกลางในการประสานความร่วมมือ และสร้างเครือข่ายระหว่างส่วนกลางและหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง ส่งเสริม สนับสนุน ติดตามประเมินผล
และพัฒนาระบบสารสนเทศ ให้มีผลลัพธ์การดำเนินงานเชิงคุณภาพ ประชาชนสุขภาพดี มีความยั่งยืนด้านสุขภาพ และมีสถานที่ปฏิบัติงาน ณ อาคาร 8 ชั้น 8 กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ กระทรวงสาธารณสุข
ปี พ.ศ. 2562 สำนักโครงการพระราชดำริ โครงการเฉลิมพระเกียรติ และกิจกรรมพิเศษ ได้ย้ายสถานที่ปฏิบัติงานจากเดิม อาคาร 8 ชั้น 8 กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ กระทรวงสาธารณสุข มาที่ห้องประชุมกลุ่มงานยุทธศาสตร์ กองบริหารกา
รสาธารณสุข อาคาร 5 ชั้น 6 ตึกสำนักงานปลัดกระทรวงสาธารณสุข
ปัจจุบันสถานที่ตั้งสำนักโครงการพระราชดำริ โครงการเฉลิมพระเกียรติ และกิจกรรมพิเศษ อยู่ที่อาคาร 6 ชั้น 6 ตึกสำนักงานปลัดกระทรวงสาธารณสุข มีการดำเนินงานตามภารกิจที่เกี่ยวข้องกับพระมหากษัตริย์ และ พระบรมวงศานุวงศ์ทุกพระองค์ อาทิ โครงการอันเนื่องมาจากพระราชดำริ โครงการจิตอาสาพระราชทาน โครงการเฉลิมพระเกียรติด้านสาธารณสุข ก
ารดูแลผู้ป่วยในพระบรมราชานุเคราะห์ พระราชานุเคราะห์ และผู้ป่วยทูลเกล้าทูลกระหม่อมถวายฎีกา รวมไปถึงการประสานงานกับหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง เพื่อมุ่งไปสู่เป้าหมายประชาชนทุกกลุ่มวัยมีสุขภาพที่ดี มีความรอบรู้ด้านสุขภาพ สามารถจัดการสุขภาพของตนเองได้อย่างเหมาะสม และอยู่ในสภาพแวดล้อมที่เอื้อต่อการมีสุขภาพดี